291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1621 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  35.91 
 
 		 184 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  35.36 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  40.11 
 
 		 185 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  38.12 
 
 		 183 aa  94.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  38.04 
 
 		 183 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  31.03 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  44.23 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  43.28 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  50.91 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  35.59 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  35.91 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  37.78 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  39.42 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  30.64 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  26.95 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  30.89 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  32.57 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  37.12 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  37.12 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  38.74 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  35.43 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  39.62 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  44.23 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  41.82 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  38.6 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  44.55 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  39.42 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  42.31 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.42 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  41.75 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  44.23 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.42 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  43.27 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  37.12 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.81 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  40.19 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  37.37 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.77 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  34.97 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  32.56 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  42.57 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  40.37 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  32.14 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  32.42 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  37.14 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  31.98 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  34.86 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.52 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  33.09 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  37.76 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  36.61 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  41.12 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  40.22 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  34.31 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  35.19 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.82 
 
 		 142 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  28.77 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  38.24 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  32.4 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  35.62 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  34.17 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  33.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  33.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  35.29 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.39 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  33.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  36.28 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  31.78 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  35.29 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  35.78 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  32.53 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  32.32 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  30.84 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  32.32 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  32.32 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  32.32 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>