72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2617 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  98.01 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  88.56 
 
 		 201 aa  360  8e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  77.04 
 
 		 201 aa  269  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  52.82 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  52.06 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  52 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  46.19 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.84 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  31.82 
 
 		 195 aa  92  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  31.12 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  32.14 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  35.5 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  31.44 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  36.5 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  30.65 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  38.31 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  32.99 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  33.17 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  29.74 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  32.66 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  32.16 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  32.16 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  29.9 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  31.16 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  29.95 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  29.85 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  29.38 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  30.85 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  29.3 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  29.02 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  29.6 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  32.87 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  27.54 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  31.53 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  31.98 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  38.53 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  28.14 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.06 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  36.26 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  27.14 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  29.27 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  32.32 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  23.36 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  29.76 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  31.96 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.2 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  31 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.88 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  30.69 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  28.43 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  36.11 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  30.34 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  28.02 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  32.08 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  28.9 
 
 		 212 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 		 239 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 		 239 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  26.78 
 
 		 228 aa  42  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  29.06 
 
 		 220 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  25.45 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  28.5 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.71 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>