162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2948 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
193 aa  397  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  52.31 
 
 
195 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  49.74 
 
 
193 aa  175  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  41.97 
 
 
194 aa  161  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  40.21 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  41.97 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  40.93 
 
 
196 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  40.3 
 
 
208 aa  131  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  40.93 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  44.74 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  38.07 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  38.07 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  37.56 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  36.79 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  35.08 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  35.75 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  36.65 
 
 
189 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  35.08 
 
 
189 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  36.55 
 
 
189 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  38.12 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  38.27 
 
 
189 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  35.6 
 
 
203 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  37.76 
 
 
189 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  34.21 
 
 
187 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  36.36 
 
 
189 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  38.27 
 
 
189 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  37.5 
 
 
189 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  27.98 
 
 
195 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  30.86 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.34 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  27.6 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  29.3 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  31.53 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  32.83 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  24.86 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.85 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  28.65 
 
 
229 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  30.97 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.7 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  34.04 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.02 
 
 
210 aa  54.7  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  23.3 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  34.83 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  27.78 
 
 
342 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  34 
 
 
213 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  26.09 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  27.34 
 
 
197 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  30.1 
 
 
209 aa  51.2  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.04 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  25.77 
 
 
221 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  33.04 
 
 
426 aa  50.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  37.14 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  37.14 
 
 
254 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  34.78 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  28.42 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 
239 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  71.43 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  31 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  32.32 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  26.67 
 
 
214 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.53 
 
 
237 aa  48.5  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  31.87 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  31.87 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.16 
 
 
233 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  31.87 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  33.67 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  25.11 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  30.63 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  29.05 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  27.18 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  27.27 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  23.15 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  30.16 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  27.66 
 
 
210 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.82 
 
 
400 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  30.69 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  28.85 
 
 
236 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  26.45 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  26.64 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  26.45 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  26.45 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  28.95 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  25.47 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  62.07 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  28.95 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  31.13 
 
 
240 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  28.95 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  61.29 
 
 
223 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>