125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2443 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  58.73 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  55.56 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  55.56 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  55.03 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  54.5 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  55.03 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  54.5 
 
 		 189 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  54.5 
 
 		 189 aa  184  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  53.72 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  52.91 
 
 		 189 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  51.32 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  50.26 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  50.26 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  50.26 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  40.8 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  44.74 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  52.5 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  37.63 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  53.33 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  41.84 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  40 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  58.42 
 
 		 208 aa  114  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  41.54 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.57 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  52.38 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  40.74 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  32.75 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  31.98 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  30.85 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  30.46 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  28.46 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  32.71 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  24.61 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.45 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  33.03 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  27.75 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.66 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  36.19 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  26.73 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  35.23 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  26.24 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  26.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  31.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  33.98 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.56 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  31 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.82 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  34.43 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  33.91 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  23.79 
 
 		 229 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  36.25 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  37.08 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  35.8 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  36.25 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  35 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  31.63 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  26.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  27.88 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.87 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.34 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.34 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.63 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  31 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  27 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  30.21 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  35.71 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  36.67 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  25.96 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  28.38 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  35 
 
 		 316 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  33.66 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  30.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  31.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  30.65 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30.21 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  31.43 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  30.39 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  32.67 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  27.27 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  27.37 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  30.06 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.65 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  25.26 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  31.68 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  34.48 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>