295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2910 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  90.71 
 
 		 183 aa  334  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  62.3 
 
 		 216 aa  227  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  58.47 
 
 		 184 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  40.11 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  40.46 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.12 
 
 		 212 aa  94.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  32.35 
 
 		 210 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  44.12 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  38.89 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  35.6 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  40.57 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.21 
 
 		 400 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  29.29 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  30.16 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  35.58 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  34.82 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  32.89 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  29.21 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  29.1 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  33.04 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  36.59 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  37.37 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  31.69 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  36.45 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  32.46 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  38.78 
 
 		 254 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  28.23 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  28 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  37.72 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  38.78 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  39.56 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  33.67 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  31.43 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  38.54 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  30 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.58 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  32.32 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  28 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.64 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  30.48 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  32.76 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  32.76 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  38.78 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  35.66 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  37.23 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  27.43 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  29.67 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  30.58 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  33.61 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  37.37 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  35.23 
 
 		 223 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  36.56 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.44 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  31.62 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  31.25 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  38.46 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  26.94 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>