147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3922 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  86.24 
 
 		 189 aa  345  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  78.84 
 
 		 189 aa  315  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  79.37 
 
 		 189 aa  309  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  79.89 
 
 		 189 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  78.84 
 
 		 189 aa  308  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  78.31 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  79.37 
 
 		 189 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  77.78 
 
 		 189 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  76.72 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  75.66 
 
 		 189 aa  297  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  75.66 
 
 		 189 aa  297  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  76.19 
 
 		 189 aa  297  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  72.34 
 
 		 187 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  55.56 
 
 		 189 aa  194  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  38.69 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  38.34 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  38.78 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  41.84 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  38.78 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  36.95 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  37.82 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  54.46 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  36.65 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  50.5 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  42.98 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  47.19 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  30.46 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  29.02 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  29.95 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  29.38 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  27.98 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  26.04 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  25.89 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25.36 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  28.14 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  29.23 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  31.68 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  35.4 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.69 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.86 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  34.29 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  37.65 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.83 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.83 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  27.56 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  33.01 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  36.84 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  25.57 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  32.22 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  33.71 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.16 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  28.95 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  26.16 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  29.75 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  26.54 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  36.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  24.88 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.95 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  26.43 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  29.13 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  31.52 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  24.88 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  35.79 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  25.53 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  26.79 
 
 		 233 aa  47.8  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  35.11 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  24.88 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  32.69 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.58 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.88 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.87 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  24.21 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  32.69 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  26.14 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  34.48 
 
 		 316 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  32.26 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  33.82 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  34 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  33.82 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  34.74 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  33.82 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  31.87 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>