78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2928 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  77.04 
 
 
201 aa  292  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  76.53 
 
 
201 aa  290  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  73.98 
 
 
201 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  52.28 
 
 
195 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  52.58 
 
 
195 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  52.78 
 
 
179 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  48.22 
 
 
195 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  37.57 
 
 
203 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  31.12 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  31.63 
 
 
195 aa  89  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  31.22 
 
 
195 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  36.87 
 
 
196 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  36.87 
 
 
196 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  32.16 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.01 
 
 
204 aa  87  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  35.86 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  32.47 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  31.44 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  32.83 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  31.44 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  29.9 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  30.93 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  29.9 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  30.93 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  28.21 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  29.9 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  29.9 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  29.38 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  29.08 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  29.23 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  30.54 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  35.77 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  28.14 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  27.46 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.22 
 
 
224 aa  61.6  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  27.71 
 
 
225 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  33.03 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  39.81 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  30.23 
 
 
219 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  33.33 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.08 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  31 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  39.05 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  32.99 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  31.17 
 
 
224 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  33.98 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  27.27 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.66 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  29.29 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  27.27 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  35.42 
 
 
234 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  27.07 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  23.19 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  31.31 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  31.91 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  33.07 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  32 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  27.14 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  27.14 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  29.55 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  29.7 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  35.42 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  26.63 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.61 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  32.08 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  20.19 
 
 
216 aa  42  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 
209 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  28.7 
 
 
217 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  28.71 
 
 
184 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  33.62 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.06 
 
 
222 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  25.77 
 
 
205 aa  41.6  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  39.66 
 
 
426 aa  41.6  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  31.41 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>