173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2924 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  50.7 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  46.76 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  47.66 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  39.64 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.17 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  38.43 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  37.21 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  39.73 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  38.36 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  32.16 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  37 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  36.09 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  37.28 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.8 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.8 
 
 		 239 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  34.38 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  36.4 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  34.4 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  39.27 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  39.27 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  39.27 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  37.9 
 
 		 254 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  37.9 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.15 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  40.36 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  39.45 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.08 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  31.74 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  46.32 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  41.67 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  40.2 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  41.11 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  34.84 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  35.61 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  38.61 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  38 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  27.56 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  34.76 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  36.52 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  41.3 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  41.05 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  41.05 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.13 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  35.79 
 
 		 241 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  32.03 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  28.81 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  35.79 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  30.28 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  35.79 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  37.93 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.79 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  37.63 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.95 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.17 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  34.74 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  24.02 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  37.89 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32.82 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  34.95 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  29.58 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  33.98 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  35.29 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  30.28 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  30.28 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  33 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  37.62 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  30.87 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  28.88 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  24.17 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  30.28 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  38.89 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  30.27 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  27.84 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  36.51 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  39.78 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  29.55 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  29.55 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  36.17 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  23.58 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  23.58 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  23.58 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  23.58 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  30.72 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  33.7 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  28.99 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>