113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1350 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  98.94 
 
 
189 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  98.94 
 
 
189 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  92.59 
 
 
189 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  92.06 
 
 
189 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  88.89 
 
 
189 aa  346  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  88.89 
 
 
189 aa  346  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  88.36 
 
 
189 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  88.36 
 
 
189 aa  344  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  88.36 
 
 
189 aa  343  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  75.66 
 
 
189 aa  304  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  76.19 
 
 
189 aa  297  7e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  73.54 
 
 
189 aa  286  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  69.15 
 
 
187 aa  265  4e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  50.26 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  42.35 
 
 
196 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  41.03 
 
 
193 aa  121  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  40.4 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  36.19 
 
 
208 aa  119  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  39.9 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  37.56 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  54.46 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 
194 aa  114  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  37.32 
 
 
195 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  45 
 
 
203 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  32.14 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  29.38 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  28.87 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  26.09 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  28.14 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  24.1 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.01 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  29.9 
 
 
201 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  29.89 
 
 
205 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  23.98 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  27.74 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 
214 aa  58.9  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  33.98 
 
 
209 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.99 
 
 
234 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  28.42 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  40.7 
 
 
240 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 
241 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  30.77 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  26.38 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  32.12 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  37.78 
 
 
229 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  26.47 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  27.88 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  29.36 
 
 
212 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  30.1 
 
 
210 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.66 
 
 
342 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  31.58 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  43.33 
 
 
382 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  26.75 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  34.07 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  36.47 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  24.56 
 
 
183 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  25 
 
 
243 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  26.54 
 
 
213 aa  45.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  35.29 
 
 
236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  28.71 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  30.3 
 
 
227 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  35.29 
 
 
236 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  30.68 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  29.46 
 
 
228 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  36.76 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  45 
 
 
426 aa  45.1  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  30.61 
 
 
244 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  27.22 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  30.17 
 
 
213 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  31.73 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  27.87 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  27.87 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  34.88 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  35.16 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  27.87 
 
 
218 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  36.76 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  34.85 
 
 
400 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  29.17 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  27.19 
 
 
218 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.07 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  29.47 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  42.37 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  31.73 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>