68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1178 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  88.14 
 
 		 195 aa  344  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  52.06 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  51.03 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  49.48 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  51.46 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  52.28 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  44.03 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  29.84 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.13 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  29.02 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  27.84 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  27.04 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  27.98 
 
 		 195 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  27.98 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  32.29 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  32.81 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  32.12 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  27.94 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  26.18 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  26.7 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  33.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  25.89 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  24.61 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  24.35 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  23.2 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  23.98 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  23.98 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  23.98 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.11 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  22.68 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  44.33 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  23.56 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  23.04 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  30.3 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  23.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  23.35 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  35.42 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  32.74 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.01 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  34.38 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.57 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.66 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  24.14 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  32.58 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  29.81 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  36.26 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  29.75 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  25.12 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  33.93 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.59 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  33.67 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.53 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  25.7 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  32.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  25.81 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  26.87 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  25.27 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 440 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  32.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  31.96 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  25.38 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  25.38 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>