139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3417 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  44.78 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  43.28 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  43.78 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  40.3 
 
 		 193 aa  131  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  38.83 
 
 		 189 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  38.83 
 
 		 189 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  38.92 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  38.83 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  37.93 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  38.42 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  36.89 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  37.81 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  37.81 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  37.13 
 
 		 195 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  57.29 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  36.41 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  36.41 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  36.19 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  36.45 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  36.95 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  58.42 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  34.65 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.83 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  33.82 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  34.67 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  26.87 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  27.94 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.18 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  27.03 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  33.94 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  39.56 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  30.54 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  31.53 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.69 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.05 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  46.27 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  38.04 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  31.37 
 
 		 224 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  26.51 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  30.85 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  30.3 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  39.6 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  30.3 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  30.3 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  31.73 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.88 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  36.79 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  44.78 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  38.04 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  61.76 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  38.61 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.63 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  26.73 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  47.62 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  47.62 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  23.68 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  28.72 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  30.69 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  29.7 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  29.7 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.3 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  35.92 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  26.89 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  24.54 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  29.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  37.62 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  54.55 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  44.78 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  31.88 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  25 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  24.53 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  36.63 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  28.97 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  36.63 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  25.97 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  27.72 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  27.72 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  27.72 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  27.72 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  27.72 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  43.86 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  41.79 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  37.37 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  28.71 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  32.98 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  41.79 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  41.79 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>