58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1271 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  49 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  51.32 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  50 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  47.47 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  46.97 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  40.1 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  40.31 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  33.85 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  28.12 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  29.23 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  30.5 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  29.02 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  31.34 
 
 		 193 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  28.14 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  30.3 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  38.4 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  32.32 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  26.32 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  26.94 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  31.37 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  28.28 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  26.67 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  25.91 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  25.64 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  25.91 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  27.94 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  32.71 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  32.42 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  39.58 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  26.54 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  26.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  31.96 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  25.12 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  27.68 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  36.28 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  29.2 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  33.64 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.13 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.13 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  31 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  33.94 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  30.69 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  27.72 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  37.78 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  31.03 
 
 		 219 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  31.37 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  32.76 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>