147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3930 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  44.04 
 
 		 195 aa  178  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  41.97 
 
 		 193 aa  161  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  41.24 
 
 		 195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  41.36 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  38.97 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  38.46 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  37.13 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  38.86 
 
 		 204 aa  130  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  37.81 
 
 		 208 aa  124  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  52.5 
 
 		 189 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  38.69 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  38.27 
 
 		 189 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  37.11 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  37.24 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  37.24 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  38.27 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  44.53 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  46.77 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  36.22 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  34.74 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  51 
 
 		 187 aa  101  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  29.02 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.12 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  32.32 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  27.46 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  30.65 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  30.15 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  31.12 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  27.78 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  34.65 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  30.1 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  28.4 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  31.91 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  38.2 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  31.73 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.53 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  32.43 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  30.08 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.53 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  31.09 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  24.23 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  30.43 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  32.61 
 
 		 215 aa  51.2  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  29.25 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  27.37 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  30.43 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  30.97 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  28.37 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  26.69 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  25.86 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  38.98 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  31.62 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  32.97 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  30.39 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.89 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  33.06 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  36.11 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  24.62 
 
 		 342 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  36.11 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  20.51 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  31.18 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  23.88 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  32.86 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.69 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  65.52 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  27.84 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  36.07 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  34.43 
 
 		 254 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  34.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  31.91 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  26.37 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  22.73 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  30 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  25.86 
 
 		 226 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  34.43 
 
 		 241 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>