155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1173 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  38.86 
 
 
194 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  37.24 
 
 
195 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  47.62 
 
 
196 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  34.9 
 
 
193 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  34.54 
 
 
195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  37.44 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  34.83 
 
 
208 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  35.75 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  34.57 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  43.8 
 
 
196 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  46.73 
 
 
196 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  34.72 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  27.04 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  35.08 
 
 
187 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.25 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  32.29 
 
 
189 aa  92  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  33.16 
 
 
189 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  26.94 
 
 
195 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  50.56 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  50.56 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  32.81 
 
 
189 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  32.81 
 
 
189 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  32.14 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  49.44 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  32.14 
 
 
189 aa  89.4  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  32.14 
 
 
189 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  48.31 
 
 
189 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  32.14 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  32.14 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  47.19 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.12 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  29.07 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  29.22 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  34.01 
 
 
201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  35.87 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  30.73 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  28.3 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  37.23 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  28 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  34.78 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  34.34 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 
218 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  32.29 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  30.68 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  33.96 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  29.91 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  30.11 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  23.83 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  32.38 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  31.19 
 
 
218 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  28.04 
 
 
212 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  28.04 
 
 
212 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  22.42 
 
 
225 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  31.19 
 
 
218 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  31.19 
 
 
218 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  30.82 
 
 
243 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  29.13 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.82 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  29.7 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.61 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  28.04 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  30.21 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  24.64 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  30.21 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  28.26 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  30.21 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  36.73 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  30.21 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  27.27 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  23.94 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  27.27 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  23.53 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  31.13 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  30.39 
 
 
217 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 
239 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.02 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 
239 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 
218 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  40.68 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  30.36 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  31.65 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  27.69 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  31.18 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  25.96 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  25.77 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.32 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  28.72 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  29 
 
 
234 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>