173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3314 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  99.57 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  98.7 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  98.7 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  98.7 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  96.54 
 
 		 231 aa  434  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  68.4 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  67.1 
 
 		 231 aa  319  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  63.48 
 
 		 235 aa  304  6e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  61.47 
 
 		 231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  55.72 
 
 		 205 aa  239  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  35.19 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  35.62 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  34.76 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  34.76 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  34.76 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  34.76 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  34.76 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  36.21 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  38.27 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  34.33 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  34.33 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  34.33 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  34.62 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  31.88 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  31.88 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  31.44 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.03 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  27.43 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  34.19 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  29.91 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  30.86 
 
 		 222 aa  92  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  37.12 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.27 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  33.57 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.29 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  26.51 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  34.04 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  36.79 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  36.79 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  28.47 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  37.74 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  33.01 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.98 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  35.24 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  38.24 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.08 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.21 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.31 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  35.92 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  32.35 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  33 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.94 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.94 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  38.2 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  27.69 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  35.56 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  35.11 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  36.26 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  36.27 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  34.58 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  26.43 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  27.16 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  30.28 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.67 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.11 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  36.89 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  30.09 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  32.32 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  33.7 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.41 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  27.56 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  32.98 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  33.01 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  32.81 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  23.81 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  37.65 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  32.77 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  34.07 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  27.95 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  27.03 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  26.92 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.91 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>