132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6270 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6270  NUDIX hydrolase  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  37.75 
 
 
137 aa  89.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
251 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
286 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
171 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  39.88 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
171 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  40.56 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
248 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  32.61 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.41 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.97 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  36.64 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  33.99 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.64 
 
 
362 aa  65.1  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
244 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 
212 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
260 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
166 aa  62.8  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  36.96 
 
 
344 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  36.96 
 
 
344 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.61 
 
 
351 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
239 aa  62  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  30.86 
 
 
662 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
244 aa  61.6  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
252 aa  61.2  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  34 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.75 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
229 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
130 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
267 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  34.33 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
140 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  36.36 
 
 
348 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
248 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
263 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
303 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  37.27 
 
 
342 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.07 
 
 
345 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  38 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  32.21 
 
 
232 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
269 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
228 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  27.95 
 
 
250 aa  55.1  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  36 
 
 
140 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  32.28 
 
 
345 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
320 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  26.14 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.92 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0205  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 
338 aa  52  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.445871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
140 aa  52  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
143 aa  51.6  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0228  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.87 
 
 
356 aa  51.2  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  37.34 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
135 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
284 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
156 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
143 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.5 
 
 
346 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
144 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>