More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0916 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 505 aa  934    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  45.95 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 513 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  48.14 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 523 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  48.26 
 
 		 584 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  46.41 
 
 		 538 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  46.14 
 
 		 537 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 541 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 535 aa  300  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 541 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 503 aa  297  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  47.41 
 
 		 530 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  40.08 
 
 		 518 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 		 513 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 500 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 574 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 460 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.14 
 
 		 543 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 512 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 469 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.54 
 
 		 504 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.55 
 
 		 532 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 512 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 505 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.7 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.21 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.7 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.27 
 
 		 529 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  30.89 
 
 		 418 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 		 458 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 445 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 474 aa  136  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.95 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  33.95 
 
 		 582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.12 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.77 
 
 		 490 aa  133  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6092  major facilitator superfamily permease  34.33 
 
 		 473 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 502 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.1 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 515 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 523 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  30.67 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  30.52 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1455  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.18 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 519 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 468 aa  127  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 478 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 518 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.68 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.34 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  31.73 
 
 		 530 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2655  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0128885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1680  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1791  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 455 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 541 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5842  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 456 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>