More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3246 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 
584 aa  1119    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  66.27 
 
 
525 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  76.49 
 
 
538 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  78.3 
 
 
541 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  76.38 
 
 
537 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  75.83 
 
 
530 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  79.11 
 
 
541 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  79.11 
 
 
541 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  76.83 
 
 
535 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  64.13 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  55.95 
 
 
523 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  50.4 
 
 
518 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  51.25 
 
 
509 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  49.5 
 
 
521 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  46.73 
 
 
516 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  54.74 
 
 
516 aa  347  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 
503 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  48.37 
 
 
505 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 
513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  42.65 
 
 
461 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 
523 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  40.93 
 
 
455 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  33.82 
 
 
510 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  36.26 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
505 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 
522 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 
504 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  35.47 
 
 
514 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
574 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.04 
 
 
543 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.44 
 
 
500 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
516 aa  183  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 
522 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
502 aa  180  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  36.09 
 
 
582 aa  179  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  36.22 
 
 
510 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.09 
 
 
553 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.92 
 
 
587 aa  178  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
521 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.63 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.71 
 
 
512 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.81 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.17 
 
 
512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.08 
 
 
512 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.17 
 
 
512 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.17 
 
 
512 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.49 
 
 
512 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.3 
 
 
469 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
522 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.26 
 
 
528 aa  170  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
511 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.87 
 
 
532 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.56 
 
 
506 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  36.49 
 
 
523 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  29.45 
 
 
521 aa  163  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  34.17 
 
 
519 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  36.28 
 
 
518 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  32.11 
 
 
519 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 
478 aa  159  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 
502 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  34.54 
 
 
483 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  34.54 
 
 
483 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  33.76 
 
 
480 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.69 
 
 
522 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.58 
 
 
480 aa  150  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.24 
 
 
527 aa  150  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  31.99 
 
 
509 aa  148  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
528 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 
475 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.99 
 
 
488 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
520 aa  144  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.97 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  29.71 
 
 
537 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.95 
 
 
483 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 
458 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  30.73 
 
 
444 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  31.36 
 
 
483 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  31.14 
 
 
519 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 
763 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 
489 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.6 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  30.88 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.6 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 
478 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  26.87 
 
 
582 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
503 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
474 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
532 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  26.62 
 
 
582 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.31 
 
 
458 aa  137  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 
461 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.69 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4663  major facilitator transporter  31.67 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.502876  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.09 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3579  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 
475 aa  135  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.23 
 
 
478 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  25.87 
 
 
582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>