More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2017 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  100 
 
 		 516 aa  956    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  48.84 
 
 		 525 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.07 
 
 		 584 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  52.98 
 
 		 537 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  52.72 
 
 		 538 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  52.72 
 
 		 541 aa  358  9e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 530 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  56.23 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  56.23 
 
 		 541 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  45.29 
 
 		 518 aa  346  7e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 521 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  44.8 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 513 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  43.57 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 523 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 		 505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.25 
 
 		 469 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 574 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.32 
 
 		 522 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.87 
 
 		 504 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 502 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 522 aa  156  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 512 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 512 aa  153  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.88 
 
 		 480 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.52 
 
 		 582 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.1 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 528 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 553 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.56 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.88 
 
 		 532 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  29.74 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.66 
 
 		 488 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.49 
 
 		 467 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  35.1 
 
 		 444 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 520 aa  136  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.54 
 
 		 488 aa  136  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.37 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.46 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.5 
 
 		 579 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 519 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 519 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 507 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 518 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.11 
 
 		 527 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  31.23 
 
 		 519 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 458 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 		 486 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.72 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.32 
 
 		 525 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.46 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 506 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.55 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 506 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.01 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  33.99 
 
 		 523 aa  123  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 478 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.43 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3647  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.86 
 
 		 522 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>