More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4865 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  100 
 
 		 523 aa  1025    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  51.63 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  51.98 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  49.9 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.85 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  56.22 
 
 		 538 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  55.8 
 
 		 537 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  56.57 
 
 		 535 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  55.12 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  49.42 
 
 		 521 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  55.35 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 541 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 509 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 516 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  53.48 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 523 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 		 505 aa  243  5e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  37.13 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 		 574 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.03 
 
 		 522 aa  199  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 455 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 500 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 553 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.05 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.34 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.19 
 
 		 522 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  33.04 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  33.4 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 469 aa  181  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 521 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 512 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 512 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 518 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.98 
 
 		 506 aa  177  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.71 
 
 		 532 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 512 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 515 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.52 
 
 		 522 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 509 aa  173  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.86 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 523 aa  170  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 529 aa  170  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 489 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  30.04 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 524 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.51 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 		 527 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.99 
 
 		 467 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.28 
 
 		 529 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 		 522 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 517 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 		 522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.86 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.97 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.49 
 
 		 502 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.17 
 
 		 474 aa  154  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 458 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 444 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 583 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 456 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.4 
 
 		 516 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.26 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.09 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6092  major facilitator superfamily permease  31.65 
 
 		 473 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 478 aa  147  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 511 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 487 aa  146  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  26.13 
 
 		 507 aa  146  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0007  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.83 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.47 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>