More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2923 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  86.92 
 
 
535 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  90.02 
 
 
537 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  100 
 
 
541 aa  1023    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  82.87 
 
 
530 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  86.76 
 
 
538 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  100 
 
 
541 aa  1023    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  99.08 
 
 
541 aa  1016    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  79.58 
 
 
584 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  62.06 
 
 
525 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  60.82 
 
 
513 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  55.65 
 
 
523 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  47.95 
 
 
518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 
509 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  50.51 
 
 
521 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  47.25 
 
 
516 aa  365  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  53.5 
 
 
516 aa  333  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
503 aa  324  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
523 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
513 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 
505 aa  239  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  42.24 
 
 
461 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  42.62 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  36.14 
 
 
510 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
574 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  37.53 
 
 
460 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
522 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.59 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  33.75 
 
 
512 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.27 
 
 
512 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  32.64 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  32.64 
 
 
512 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  32.64 
 
 
512 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.73 
 
 
512 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.93 
 
 
587 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.94 
 
 
512 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.77 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.34 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.46 
 
 
522 aa  183  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.86 
 
 
522 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 
521 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
511 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  30.73 
 
 
500 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.16 
 
 
528 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 
502 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
515 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.88 
 
 
514 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 
489 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.01 
 
 
532 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.47 
 
 
506 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  36.43 
 
 
518 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  36.43 
 
 
519 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.26 
 
 
469 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  33.84 
 
 
510 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.6 
 
 
522 aa  167  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  32.23 
 
 
529 aa  166  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  36.11 
 
 
523 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.62 
 
 
516 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  30.06 
 
 
521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.57 
 
 
478 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.09 
 
 
519 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  32.07 
 
 
444 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.73 
 
 
502 aa  153  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  28.78 
 
 
530 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.8 
 
 
480 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.15 
 
 
469 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 
478 aa  150  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.21 
 
 
458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 
478 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
517 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  30.77 
 
 
509 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.64 
 
 
484 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 
488 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  34.96 
 
 
480 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.61 
 
 
478 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.29 
 
 
537 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.5 
 
 
528 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.21 
 
 
527 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  35.22 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  35.22 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.75 
 
 
532 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.17 
 
 
498 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 
484 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  33.56 
 
 
488 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 
486 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 
524 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31 
 
 
527 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
503 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  31.19 
 
 
468 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  31.19 
 
 
468 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  30.32 
 
 
519 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 
489 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.83 
 
 
472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>