More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0968 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  87.3 
 
 		 455 aa  545  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  51.33 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  41.23 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.36 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 541 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 541 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 541 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 510 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  42.5 
 
 		 530 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 535 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  40.51 
 
 		 503 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  35.34 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 521 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 509 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  44.05 
 
 		 516 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 		 469 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.41 
 
 		 521 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 574 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.04 
 
 		 516 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.55 
 
 		 582 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  34.93 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  35.55 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 522 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.97 
 
 		 532 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 512 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.62 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.77 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 514 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 		 522 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.36 
 
 		 543 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 512 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 506 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 512 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 512 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 478 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 505 aa  162  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 529 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  31.65 
 
 		 521 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.33 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0366  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.74 
 
 		 461 aa  156  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0742092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.85 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.55 
 
 		 483 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 510 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.42 
 
 		 502 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 519 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.46 
 
 		 551 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  26.7 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  32.06 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.57 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.46 
 
 		 511 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  26.87 
 
 		 511 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  29.82 
 
 		 467 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.46 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 511 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.91 
 
 		 528 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 		 508 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  24.81 
 
 		 507 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.26 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.26 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.28 
 
 		 521 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.12 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  24.81 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.62 
 
 		 511 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.77 
 
 		 458 aa  143  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>