More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4568 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  843    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  56.67 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 461 aa  266  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  49.53 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 523 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  35.31 
 
 		 525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 503 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  36.32 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 523 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 513 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 538 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 541 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.17 
 
 		 584 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 511 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4513  hypothetical protein  40.62 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 463 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.55 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 535 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.04 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.87 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 574 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.59 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.98 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.25 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.67 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 484 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 510 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 528 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.8 
 
 		 516 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6092  major facilitator superfamily permease  35.21 
 
 		 473 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08060  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  34.62 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.27 
 
 		 508 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 553 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.41 
 
 		 502 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.4 
 
 		 587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.64 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.01 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  32.41 
 
 		 521 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 506 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.44 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.02 
 
 		 504 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.15 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 516 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 522 aa  136  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 518 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.41 
 
 		 497 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.83 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 477 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 503 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.01 
 
 		 480 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  29.25 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.24 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.34 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.88 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  32.2 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.84 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.73 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  29.62 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>