More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0132 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0146  major facilitator transporter  85.45 
 
 		 541 aa  735    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3312  major facilitator transporter  86.96 
 
 		 537 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2923  major facilitator transporter  85.45 
 
 		 541 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0132  major facilitator transporter  100 
 
 		 535 aa  1014    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0122  major facilitator transporter  95.91 
 
 		 538 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0132  major facilitator transporter  85.45 
 
 		 541 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0130  major facilitator transporter  85.47 
 
 		 530 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.589693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3246  EmrB/QacA family drug resistance transporter  77.64 
 
 		 584 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.3214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  60.84 
 
 		 525 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  60.2 
 
 		 513 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4865  major facilitator transporter  56.97 
 
 		 523 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3197  hypothetical protein  49.22 
 
 		 518 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0388664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3063  major facilitator transporter  51.56 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0460  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1712  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2017  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 513 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0916  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 505 aa  246  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.92358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0968  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335607  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1078  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 574 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  34.31 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2110  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0983806  normal  0.478447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 522 aa  203  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 512 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  37.31 
 
 		 582 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 512 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.06 
 
 		 587 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 553 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.2 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5411  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.423231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.01 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 505 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3436  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 518 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00141924  normal  0.0811342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3918  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 		 522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3942  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.12 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 500 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2043  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0394756  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1197  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.14 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.365296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.26 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 		 511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.56 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  35.09 
 
 		 514 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 528 aa  170  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 506 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.89 
 
 		 519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.9 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.96 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  31.55 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.49 
 
 		 522 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 		 498 aa  154  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 		 502 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.89 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.94 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.46 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  31.19 
 
 		 444 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.16 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 		 484 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  32.42 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.4 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 		 527 aa  144  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3532  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0144741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  30 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.76 
 
 		 530 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 520 aa  140  7e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.48 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.22 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.36 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 524 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4568  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.38 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>