104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0366 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  100 
 
 		 403 aa  803    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  45.84 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  43.11 
 
 		 451 aa  295  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  43.71 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  44.31 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  38.34 
 
 		 435 aa  260  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  35.47 
 
 		 384 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  33.52 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  33.03 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  27.12 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  26.37 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  27.45 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  25.25 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  30.32 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  30.32 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  25.22 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  25.23 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  28.72 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1310  hypothetical protein  26.33 
 
 		 450 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00248833  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  26.84 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  25.06 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  27.93 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  24.85 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  24.85 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  26.52 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  22.48 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  25.31 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0754  hypothetical protein  29.49 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2190  outer membrane porin  26.14 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0522869  hitchhiker  0.0043507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2024  outer membrane porin  25.45 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.68601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5621  putative porin  25.07 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  21.71 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  21.71 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64720  putative porin  25.35 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1206  outer membrane porin  26.11 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  27.97 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  29.66 
 
 		 444 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  24.23 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1173  porin, putative  26.11 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121205  normal  0.068345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1739  outer membrane porin  23.72 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4392  outer membrane porin  23.75 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1059  outer membrane porin  23.26 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  28.81 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1419  outer membrane porin  24.05 
 
 		 429 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2101  porin  25.39 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2488  outer membrane porin  22.7 
 
 		 410 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.246443  normal  0.663679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4212  outer membrane porin  25.12 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4239  outer membrane porin  25.48 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4009  outer membrane porin  25.12 
 
 		 422 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4306  outer membrane porin  25.25 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4302  outer membrane porin  23.75 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3271  outer membrane porin  23.32 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24790  putative outer membrane porin  24.87 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3201  outer membrane porin  25.86 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27407  normal  0.0173746 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2267  hypothetical protein  27.08 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00968313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1339  outer membrane porin  28.57 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.868317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  25.71 
 
 		 421 aa  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2167  outer membrane porin  25.77 
 
 		 417 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  25.93 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14210  outer membrane porin  24.23 
 
 		 423 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15150  outer membrane porin  24.23 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.350785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2145  outer membrane porin  24.88 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832891  normal  0.088551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  24.23 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2734  putative porin  24.39 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5115  putative porin  24.2 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1577  outer membrane porin  31.15 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.107742  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2625  outer membrane porin  22.07 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0951208  normal  0.228202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2638  outer membrane porin  21.55 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00757787  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3198  putative porin  22.73 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2517  BenF-like porin  25.1 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  25.25 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1190  outer membrane porin  24.53 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569611  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3121  outer membrane porin  22.63 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3313  putative lipoprotein  26.21 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.474661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3987  porin D  24.54 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2058  outer membrane porin  29.51 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37260  putative porin  22.8 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.618786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  23.19 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  23.53 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01240  OprE-like outer membrane porin  37.29 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.464345  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31670  outer membrane porin OprE  23.43 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38140  outer membrane porin, OprD family  22.73 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2730  outer membrane porin  39.66 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58410  putative porin  23.9 
 
 		 484 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1260  outer membrane porin  28.79 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000749415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1458  outer membrane porin  28.79 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4332  outer membrane porin  26.54 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.994922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1023  outer membrane porin  25.81 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2103  outer membrane porin  36.84 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  23.21 
 
 		 444 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2286  outer membrane porin  36.84 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197845  normal  0.381133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1206  outer membrane porin  23.63 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4665  outer membrane porin  23.81 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.109112  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2414  putative lipoprotein  25.63 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1097  outer membrane porin  22.98 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000158939  normal  0.0454814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  23.21 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  27.88 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05170  OprE-like outer membrane porin  35.59 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0885067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1235  outer membrane porin  23.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.188174  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3682  outer membrane porin  27.87 
 
 		 417 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>