18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0123 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  100 
 
 		 405 aa  816    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  61.85 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  47.31 
 
 		 414 aa  322  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  45.24 
 
 		 402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  45.41 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  44 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  36.6 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  31.19 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  31.54 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  31.33 
 
 		 425 aa  125  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  31.82 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  28.51 
 
 		 440 aa  106  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  28.72 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  30.64 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  29.03 
 
 		 458 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  29.69 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  28 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  28.27 
 
 		 451 aa  46.6  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>