40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4147 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  100 
 
 		 407 aa  834    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  58.75 
 
 		 406 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  58.48 
 
 		 398 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  33.01 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  28.47 
 
 		 402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  27.45 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  29.89 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  26.88 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  26.79 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  29.75 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  34.86 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  26.91 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  25.35 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  24.17 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  24.94 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  23.62 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3175  outer membrane porin  24.64 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.442937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  23.67 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  24.72 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  23.67 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  23.54 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  22.61 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  23.08 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  23.08 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  26.21 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  22.75 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  22.75 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4940  outer membrane porin  26.7 
 
 		 439 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.849665  hitchhiker  0.000000184372 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  24.04 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49310  outer membrane porin  22.5 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2476  outer membrane protein  25.41 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0295  outer membrane porin  25.67 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.258921  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0031  hypothetical protein  23.5 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28400  outer membrane OprD family porin  25.41 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00818285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2839  porin  25.16 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33410  porin  24.54 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0650483  normal  0.0333404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  26.46 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3212  outer membrane porin  32.81 
 
 		 414 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4735  outer membrane porin  22.39 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3268  outer membrane porin  23.88 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal  0.0282979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>