15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0195 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  100 
 
 
414 aa  827    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  63.51 
 
 
402 aa  514  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  47.53 
 
 
406 aa  341  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  47.29 
 
 
406 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  47.31 
 
 
405 aa  322  7e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  46.19 
 
 
420 aa  311  1e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  41.49 
 
 
421 aa  261  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  38.39 
 
 
425 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  38.17 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  35.28 
 
 
431 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  34.4 
 
 
424 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  34 
 
 
440 aa  155  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  24.23 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  26.59 
 
 
452 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  29.07 
 
 
458 aa  43.5  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>