31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0474 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  100 
 
 		 407 aa  809    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  44.31 
 
 		 403 aa  300  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  43.94 
 
 		 402 aa  285  8e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  42.51 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0715  outer membrane porin  40.96 
 
 		 451 aa  242  7e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0142723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3627  outer membrane porin  34.51 
 
 		 435 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  36.47 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0734  outer membrane porin  33.01 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.536638  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4147  outer membrane porin  31.83 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.17719 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4293  outer membrane porin  26.03 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0195017  normal  0.981008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0255  outer membrane porin  26.17 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  27.84 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  26.21 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0265  hypothetical protein  28.37 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000273485  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  32.07 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0754  hypothetical protein  32.79 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1660  outer membrane porin  26.06 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.448938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1991  hypothetical protein  26.06 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0954759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2788  outer membrane porin  27.49 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.149615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0137  hypothetical protein  28.49 
 
 		 447 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0760948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0307  hypothetical protein  28.49 
 
 		 280 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000284732  decreased coverage  0.00000657786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3385  outer membrane porin  26.04 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1310  hypothetical protein  27.16 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00248833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3692  outer membrane porin  27.27 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4295  outer membrane porin  29.9 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0341226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1917  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0922  outer membrane porin  28.87 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  28.12 
 
 		 388 aa  43.5  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42090  outer membrane porin, OprD family  34.48 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1155  outer membrane porin  28.95 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0883  outer membrane porin  27.84 
 
 		 459 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>