16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1310 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  908    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00248833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1540  outer membrane porin  24.81 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000339272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1456  hypothetical protein  27.7 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  26.33 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1763  hypothetical protein  27.24 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1463  hypothetical protein  23.1 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0242  porin  25.37 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02020  putative outer membrane porin  25.37 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.485691 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0474  outer membrane porin  26.81 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000458474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0822  outer membrane porin  26.74 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43059  normal  0.142629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0833  outer membrane porin  27.91 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4394  outer membrane porin  26.74 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1215  outer membrane porin  21.76 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000387662  hitchhiker  0.0000000148872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1497  hypothetical protein  21.76 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0799  outer membrane porin  25.58 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.230822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5281  outer membrane porin  24.11 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.746207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>