17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1708 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  100 
 
 		 421 aa  832    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  44.62 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  44.01 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  42.27 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  38.66 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  37.64 
 
 		 405 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  35.94 
 
 		 420 aa  209  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  33.33 
 
 		 425 aa  163  7e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  33.12 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  31.51 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  32.97 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  30.39 
 
 		 440 aa  139  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  25.88 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  26.59 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  26.02 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  29.51 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  25.56 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>