More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4703 on replicon NC_010000
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010000  Sbal195_4703  type II secretion system protein E  100 
 
 		 574 aa  1189    Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.91 
 
 		 569 aa  147  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.91 
 
 		 569 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.71 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 559 aa  143  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.45 
 
 		 570 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.91 
 
 		 569 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.49 
 
 		 564 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.45 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.45 
 
 		 570 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.78 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  26.49 
 
 		 564 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.48 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  29.23 
 
 		 501 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.68 
 
 		 569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.48 
 
 		 569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.2 
 
 		 578 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.48 
 
 		 569 aa  140  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 885 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  27.44 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  27.15 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.59 
 
 		 568 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  26.68 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.59 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  28.1 
 
 		 544 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  26.68 
 
 		 570 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.12 
 
 		 569 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  26.24 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.24 
 
 		 568 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.25 
 
 		 562 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  27.09 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  26.13 
 
 		 579 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  28.32 
 
 		 613 aa  134  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  27.59 
 
 		 503 aa  134  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  28.97 
 
 		 519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  27 
 
 		 561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  28.18 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  28.19 
 
 		 498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  29.44 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  27.91 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  28.75 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  29.4 
 
 		 505 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 586 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  27.76 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  28.97 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  26.81 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  27.14 
 
 		 571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 616 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  27.61 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  26.76 
 
 		 567 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.32 
 
 		 567 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  28.67 
 
 		 494 aa  130  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  26.78 
 
 		 500 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  26.22 
 
 		 558 aa  130  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  29.1 
 
 		 498 aa  130  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  28.94 
 
 		 486 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  29.09 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  27.19 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  28.74 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  28.74 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  27.01 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  27.17 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  27.17 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 888 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  29.95 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  27.17 
 
 		 521 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  27 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  27.34 
 
 		 490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  27.39 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  27.29 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  27.56 
 
 		 577 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  29.67 
 
 		 746 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  27.17 
 
 		 521 aa  128  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  28.27 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.62 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  27.79 
 
 		 566 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  28.15 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3009  type II secretion system protein E  27.67 
 
 		 561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  28.27 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 591 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  28.39 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.23 
 
 		 549 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  27.61 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.55 
 
 		 563 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 538 aa  127  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 832 aa  127  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  27.79 
 
 		 574 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  27.67 
 
 		 606 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.65 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  27.12 
 
 		 574 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  26.82 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.99 
 
 		 568 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 569 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  26.92 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  27.9 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>