More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3207 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 358 aa  739    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0036  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  69.14 
 
 		 355 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2400  methionine synthase (B12-dependent)  65.23 
 
 		 353 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434892  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  57.06 
 
 		 1272 aa  413  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  56.76 
 
 		 1247 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  56.65 
 
 		 1245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  56.09 
 
 		 1246 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  56.43 
 
 		 1271 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  55.43 
 
 		 1234 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  58.14 
 
 		 1250 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  55.71 
 
 		 1234 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  57.69 
 
 		 1232 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  56.65 
 
 		 1250 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  56.86 
 
 		 1278 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  54.73 
 
 		 1239 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  54.44 
 
 		 1239 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  54.62 
 
 		 1263 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  57.56 
 
 		 1237 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 		 1236 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  55.62 
 
 		 1236 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  55.98 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  54.26 
 
 		 1262 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 		 1235 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 		 1235 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  54.76 
 
 		 1271 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 		 1235 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  54.71 
 
 		 1228 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  55.17 
 
 		 1235 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  56.47 
 
 		 1248 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  55.43 
 
 		 1227 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  56.72 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  53.55 
 
 		 1227 aa  384  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  54.52 
 
 		 1257 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  57.14 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  54.18 
 
 		 1249 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  53.07 
 
 		 1250 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  51.82 
 
 		 1245 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  52.89 
 
 		 1293 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  53.6 
 
 		 1245 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  52.52 
 
 		 1238 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  52.45 
 
 		 1226 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  53.37 
 
 		 1257 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  53.37 
 
 		 1257 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  53.85 
 
 		 1219 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  54.47 
 
 		 1271 aa  378  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  53.53 
 
 		 353 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  54.52 
 
 		 1250 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  53.69 
 
 		 1264 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  52.91 
 
 		 1226 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  53.74 
 
 		 1232 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  54.71 
 
 		 1236 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  52 
 
 		 1245 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  52.79 
 
 		 1250 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  55.59 
 
 		 1257 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  52.79 
 
 		 1250 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  55.33 
 
 		 1228 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2010  B12-dependent methionine synthase  54.63 
 
 		 1233 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  53.31 
 
 		 1228 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  54.99 
 
 		 1263 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  54.7 
 
 		 1261 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  54.7 
 
 		 1261 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  57.4 
 
 		 1227 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  54.14 
 
 		 349 aa  371  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  52.02 
 
 		 1244 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  51.75 
 
 		 1246 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  53.89 
 
 		 1251 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  54.79 
 
 		 1228 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  52.02 
 
 		 1244 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  53.06 
 
 		 1230 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  53.06 
 
 		 1230 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  52.12 
 
 		 1232 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  51.59 
 
 		 1244 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  51.59 
 
 		 1225 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  53.22 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  52.24 
 
 		 1239 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  53.06 
 
 		 1231 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  53.82 
 
 		 1226 aa  368  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  51.45 
 
 		 1244 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  51.73 
 
 		 1244 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  54.18 
 
 		 1240 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  51.62 
 
 		 1240 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  53.22 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  52.77 
 
 		 1227 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  56.51 
 
 		 1227 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  53.74 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  56.21 
 
 		 1227 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  50.72 
 
 		 1230 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  53.45 
 
 		 1267 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03712  B12-dependent methionine synthase  52.15 
 
 		 1226 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  53.98 
 
 		 1220 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  56.21 
 
 		 1227 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  52.65 
 
 		 339 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>