More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2400 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2400  methionine synthase (B12-dependent)  100 
 
 		 353 aa  723    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434892  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  65.23 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0036  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  62.64 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  57.4 
 
 		 1236 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1278 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  56.4 
 
 		 1247 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  55.59 
 
 		 1245 aa  397  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  57.1 
 
 		 1234 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  57.4 
 
 		 1234 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  55.43 
 
 		 1239 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  55.75 
 
 		 1227 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  56.55 
 
 		 1271 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  55.14 
 
 		 1235 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  54.86 
 
 		 1239 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  55.52 
 
 		 1227 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  55 
 
 		 1228 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  56.34 
 
 		 1228 aa  385  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  55.43 
 
 		 1236 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  56.85 
 
 		 1293 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  54.57 
 
 		 1235 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  56 
 
 		 1237 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  55.29 
 
 		 1246 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  55.65 
 
 		 1227 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  56.38 
 
 		 1235 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  56.4 
 
 		 1248 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  54.57 
 
 		 1235 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  55.94 
 
 		 1227 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  54.84 
 
 		 1226 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  56.21 
 
 		 1250 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  54.34 
 
 		 1257 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  55.03 
 
 		 1257 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  55.98 
 
 		 1232 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  54.57 
 
 		 1249 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  56.8 
 
 		 1228 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  52.87 
 
 		 1245 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  53.67 
 
 		 1272 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  53.39 
 
 		 1236 aa  374  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  53.76 
 
 		 1245 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  54.09 
 
 		 1245 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  54.46 
 
 		 1238 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  54.62 
 
 		 1257 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0113  B12-dependent methionine synthase  53.76 
 
 		 1227 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.352445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  56.08 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0368  B12-dependent methionine synthase  54.39 
 
 		 1231 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  54.68 
 
 		 1230 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  57.01 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0403  B12-dependent methionine synthase  53.67 
 
 		 1271 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0459446  hitchhiker  0.000026899 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  57.28 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  56.08 
 
 		 359 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0710  B12-dependent methionine synthase  53.2 
 
 		 1240 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  54.36 
 
 		 1267 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  57.01 
 
 		 346 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  54.68 
 
 		 1230 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  54.63 
 
 		 1263 aa  373  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  52.72 
 
 		 1264 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  52.63 
 
 		 1244 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  52.35 
 
 		 1244 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  53.19 
 
 		 1250 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  51.23 
 
 		 1244 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  51.78 
 
 		 1244 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  52.31 
 
 		 1225 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  52.42 
 
 		 1233 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  50.56 
 
 		 1262 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0449  B12-dependent methionine synthase  53.31 
 
 		 1271 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  53.25 
 
 		 1226 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  51.23 
 
 		 1244 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0369  B12-dependent methionine synthase  56.59 
 
 		 1228 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.789152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  51.8 
 
 		 1244 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  55.43 
 
 		 1227 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  53.12 
 
 		 1246 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  55.76 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  51.14 
 
 		 1230 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4011  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.960796  normal  0.0169283 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  52.39 
 
 		 1244 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4526  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.267598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  55.15 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4472  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.346478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4563  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  51.23 
 
 		 1244 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4255  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0705471  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1115  B12-dependent methionine synthase  53.27 
 
 		 1241 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  52.12 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  52.59 
 
 		 1250 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  55.13 
 
 		 1227 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  52.59 
 
 		 1250 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  53.59 
 
 		 1251 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  53.55 
 
 		 1232 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03891  B12-dependent methionine synthase  54.84 
 
 		 1227 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3739  B12-dependent methionine synthase  53.37 
 
 		 1252 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03851  hypothetical protein  54.84 
 
 		 1227 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  53.98 
 
 		 1240 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  56.56 
 
 		 355 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0167  homocysteine S-methyltransferase  56.17 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  54.55 
 
 		 1227 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3978  methionine synthase  54.84 
 
 		 1227 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  55.15 
 
 		 354 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  55.33 
 
 		 1304 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  57.19 
 
 		 359 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>