More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3216 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 366 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  56.86 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  31.53 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  32.57 
 
 		 528 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  35.43 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  35.87 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  31.94 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  31.03 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  35.76 
 
 		 335 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  34.74 
 
 		 497 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  31.05 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  32.04 
 
 		 334 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  30.73 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  28.11 
 
 		 491 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 		 396 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  35.26 
 
 		 325 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.57 
 
 		 523 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  34.16 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  34.87 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  29.03 
 
 		 538 aa  89.7  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  36.05 
 
 		 321 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.89 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  35.21 
 
 		 325 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.89 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  34.87 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  34.21 
 
 		 326 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 397 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  32.98 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  34.27 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  34.97 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  34.97 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  34.51 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  32.81 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.82 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  30.37 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 798 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  27.63 
 
 		 815 aa  82  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  30.19 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.11 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  29.11 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  24.32 
 
 		 816 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  29.26 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  31.82 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.7 
 
 		 673 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  33.7 
 
 		 673 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 		 807 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  26.82 
 
 		 798 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  29.58 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  29.15 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  29.81 
 
 		 809 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  28.18 
 
 		 774 aa  74.3  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  29.96 
 
 		 803 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 853 aa  73.2  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  28.69 
 
 		 797 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 805 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  27.44 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  26.39 
 
 		 807 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  27.31 
 
 		 799 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  27.31 
 
 		 799 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  32.89 
 
 		 797 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 794 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  28.65 
 
 		 805 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  29.94 
 
 		 819 aa  69.7  0.00000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  30.34 
 
 		 882 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  29.39 
 
 		 898 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 800 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  29.11 
 
 		 835 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  29.3 
 
 		 856 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  30.67 
 
 		 835 aa  69.7  0.00000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  30.21 
 
 		 932 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  29.24 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  30.05 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 825 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 		 800 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  29.05 
 
 		 936 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  24.7 
 
 		 814 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  29.05 
 
 		 936 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 		 787 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 		 880 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  24.6 
 
 		 796 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 771 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 		 793 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  31.32 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  26.7 
 
 		 791 aa  67  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  31.72 
 
 		 793 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.58 
 
 		 817 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>