More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3781 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3781  ATPase  100 
 
 		 538 aa  1078    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  50.92 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.64 
 
 		 523 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  69.78 
 
 		 225 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  52.72 
 
 		 601 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  38.14 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  45.75 
 
 		 674 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.05 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  42.05 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  42.64 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1510  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  40.38 
 
 		 284 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  35.2 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  33.54 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  41.2 
 
 		 552 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  29.41 
 
 		 794 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  29.13 
 
 		 794 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  33.96 
 
 		 439 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  33.01 
 
 		 809 aa  99  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  33.95 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  33.95 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  32.19 
 
 		 776 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  33.65 
 
 		 794 aa  97.4  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  32.19 
 
 		 776 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  30.54 
 
 		 325 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  27.27 
 
 		 1104 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  30.73 
 
 		 326 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  27.83 
 
 		 936 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  31.47 
 
 		 816 aa  96.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  27.83 
 
 		 936 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.14 
 
 		 441 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  32.72 
 
 		 405 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.14 
 
 		 397 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.14 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  32.77 
 
 		 336 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 		 756 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  35.19 
 
 		 396 aa  94.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 		 787 aa  94.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  32.97 
 
 		 336 aa  94  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  37.16 
 
 		 788 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 853 aa  93.6  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  37.16 
 
 		 788 aa  94  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  28.01 
 
 		 772 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  32.2 
 
 		 840 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 880 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  31.73 
 
 		 797 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  31.55 
 
 		 802 aa  93.2  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  32.1 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  28.82 
 
 		 783 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 825 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  34.9 
 
 		 325 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  33.01 
 
 		 812 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  39.58 
 
 		 407 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 		 771 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  40 
 
 		 824 aa  92  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  31.55 
 
 		 801 aa  91.7  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  32.06 
 
 		 796 aa  91.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 		 809 aa  91.3  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1216  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 791 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  33.17 
 
 		 803 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1091  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 791 aa  91.3  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.529046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 898 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  33.55 
 
 		 326 aa  90.9  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  30.37 
 
 		 819 aa  90.9  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  38.93 
 
 		 783 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0650  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 791 aa  90.5  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  34.23 
 
 		 321 aa  90.9  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  32.48 
 
 		 932 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  32.88 
 
 		 821 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  33.55 
 
 		 337 aa  90.5  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  29.49 
 
 		 797 aa  90.5  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 813 aa  90.5  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  31.48 
 
 		 809 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  34.43 
 
 		 799 aa  90.5  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 		 801 aa  90.1  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  29.03 
 
 		 366 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  29.61 
 
 		 835 aa  89.7  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  31.34 
 
 		 802 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  38.85 
 
 		 798 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 800 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  32 
 
 		 800 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  31.07 
 
 		 816 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  30.58 
 
 		 817 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  38.26 
 
 		 786 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  38.13 
 
 		 800 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  37.04 
 
 		 393 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  35.1 
 
 		 335 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  33.11 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 		 810 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  33.11 
 
 		 336 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  33.11 
 
 		 326 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  33.11 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  33.11 
 
 		 326 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 		 856 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>