More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4127 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  100 
 
 		 393 aa  791    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  75.18 
 
 		 407 aa  569  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  42.42 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  32.26 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  38.73 
 
 		 528 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.24 
 
 		 225 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  40.48 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  30.9 
 
 		 326 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  30.7 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  30.7 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  30.7 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.94 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  30.26 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  29.96 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  30.26 
 
 		 326 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.89 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  32.04 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  40.34 
 
 		 538 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  38.79 
 
 		 674 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.44 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  31.68 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  32.04 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  33.85 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  33.85 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  35.19 
 
 		 601 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  30.57 
 
 		 326 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  37.74 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  35.33 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  36.52 
 
 		 524 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  33.56 
 
 		 336 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  36.84 
 
 		 551 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  33.52 
 
 		 932 aa  96.3  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  35.26 
 
 		 675 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  35.26 
 
 		 768 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  35.22 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  35.88 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  38.67 
 
 		 673 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.67 
 
 		 673 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0630  ATP-dependent protease La  34.93 
 
 		 802 aa  93.2  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00470821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  34.59 
 
 		 798 aa  92.8  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  35.71 
 
 		 814 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 800 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 800 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  35.37 
 
 		 882 aa  90.1  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5508  ATP-dependent protease La  38.13 
 
 		 835 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 801 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 798 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  34.48 
 
 		 813 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 		 797 aa  89.7  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1818  ATP-dependent protease La  38.85 
 
 		 798 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000643095  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  33.11 
 
 		 936 aa  89.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  33.11 
 
 		 936 aa  89.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 		 491 aa  89.4  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  34.94 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  33.54 
 
 		 552 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  33.71 
 
 		 825 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  34.94 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 807 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  34.29 
 
 		 835 aa  88.6  2e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 854 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  34.94 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  32.73 
 
 		 783 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  36.88 
 
 		 805 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  36.88 
 
 		 805 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 		 775 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  37.41 
 
 		 816 aa  87.8  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  31.85 
 
 		 815 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 793 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  30.57 
 
 		 779 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3066  DNA-binding ATP-dependent protease La  32.73 
 
 		 787 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 785 aa  87.4  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  33.79 
 
 		 805 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  32.12 
 
 		 783 aa  87  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  36.43 
 
 		 809 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  34.86 
 
 		 796 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 785 aa  86.7  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2874  DNA-binding ATP-dependent protease La  32.12 
 
 		 786 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 785 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2748  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 785 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000341636  normal  0.663967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 794 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1606  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 784 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000976039  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1629  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 785 aa  86.7  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000414531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  35.71 
 
 		 799 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 808 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  35.71 
 
 		 819 aa  86.3  8e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  36.17 
 
 		 807 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  35.71 
 
 		 799 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>