More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4327 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 439 aa  889    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  35.04 
 
 		 326 aa  162  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  33.63 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  34.64 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  34.29 
 
 		 335 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  35.27 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  35.38 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.83 
 
 		 326 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  34.78 
 
 		 524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.23 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  36.74 
 
 		 326 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  36.28 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  37.21 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  36.28 
 
 		 326 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  30.79 
 
 		 325 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  36.28 
 
 		 336 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  36.28 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  32.13 
 
 		 325 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  28.95 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  38.22 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  33.22 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  40.12 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  39.08 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  37.64 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  37.64 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  37.64 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  30.67 
 
 		 397 aa  100  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  33.96 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 		 814 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  33.14 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  33.73 
 
 		 803 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  34.12 
 
 		 796 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  31.36 
 
 		 778 aa  95.5  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  30.51 
 
 		 815 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 835 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  32.85 
 
 		 535 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  34.39 
 
 		 783 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 821 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  38.69 
 
 		 830 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  33.76 
 
 		 786 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  30.86 
 
 		 800 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 823 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  28.26 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  34 
 
 		 805 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  34.05 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  34.07 
 
 		 856 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 840 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 		 794 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  32.11 
 
 		 794 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 		 867 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  31.69 
 
 		 824 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 806 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 829 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  34.39 
 
 		 836 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  29.23 
 
 		 797 aa  90.5  6e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  30.11 
 
 		 823 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 806 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 806 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  30.18 
 
 		 817 aa  90.1  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  30.18 
 
 		 816 aa  89.7  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  34.12 
 
 		 898 aa  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 807 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  31.32 
 
 		 825 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  30.81 
 
 		 805 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  33.52 
 
 		 809 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 809 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  31.61 
 
 		 808 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  31.67 
 
 		 812 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 		 806 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1060  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 798 aa  89.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  33.68 
 
 		 674 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 792 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 805 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 		 817 aa  89  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 846 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.7 
 
 		 523 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 805 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 775 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.67 
 
 		 828 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 		 783 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 803 aa  87.8  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  31.87 
 
 		 806 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  28.73 
 
 		 817 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  31.64 
 
 		 780 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 779 aa  87.8  4e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  34.78 
 
 		 835 aa  87.8  4e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  31.79 
 
 		 207 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.12 
 
 		 816 aa  87.8  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 787 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  31.32 
 
 		 810 aa  87.4  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 756 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  32.32 
 
 		 810 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  30.22 
 
 		 812 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>