More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0386 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 321 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  96.26 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  87.85 
 
 		 325 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  78.57 
 
 		 326 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  78.26 
 
 		 326 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  78.88 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  78.26 
 
 		 326 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  77.95 
 
 		 326 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.4 
 
 		 326 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  77.64 
 
 		 336 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  76.09 
 
 		 326 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  75.78 
 
 		 326 aa  512  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  58.86 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  57.28 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  54.55 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  55 
 
 		 335 aa  348  5e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  56.39 
 
 		 336 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  52.22 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  77.78 
 
 		 207 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  80.91 
 
 		 119 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  39.39 
 
 		 524 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  31.31 
 
 		 397 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  31.31 
 
 		 441 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  31.31 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  35.32 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  31.56 
 
 		 397 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  33.22 
 
 		 406 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  33.22 
 
 		 406 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.06 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 405 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  33.76 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  28.95 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  39.44 
 
 		 775 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 800 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  32.8 
 
 		 1104 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  35.05 
 
 		 801 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  34.21 
 
 		 813 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  32.98 
 
 		 856 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  31.37 
 
 		 809 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  33.51 
 
 		 803 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  31.94 
 
 		 768 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 793 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  33.12 
 
 		 783 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 		 793 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  29.46 
 
 		 792 aa  99.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 797 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 775 aa  99  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 1309 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  31 
 
 		 815 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  31.77 
 
 		 783 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  31.41 
 
 		 880 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  32.68 
 
 		 932 aa  97.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 		 804 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  32.3 
 
 		 781 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 		 774 aa  96.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  30.5 
 
 		 846 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  34.27 
 
 		 809 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  32.34 
 
 		 768 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  33.74 
 
 		 835 aa  96.3  6e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  33.89 
 
 		 898 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 772 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 810 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  29.32 
 
 		 813 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  35.21 
 
 		 812 aa  96.3  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 807 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  36.62 
 
 		 827 aa  95.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 		 786 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 		 804 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  29.96 
 
 		 840 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  32.28 
 
 		 800 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  34.87 
 
 		 528 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 797 aa  95.5  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 		 794 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  30.05 
 
 		 802 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  32.28 
 
 		 800 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  30.69 
 
 		 814 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  32.17 
 
 		 796 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 797 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 		 779 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  27.97 
 
 		 808 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  31.94 
 
 		 790 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  32.14 
 
 		 936 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 824 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 797 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  32.14 
 
 		 936 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  27.37 
 
 		 535 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 800 aa  94  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  25.67 
 
 		 805 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 		 805 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  25.67 
 
 		 805 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.05 
 
 		 225 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  30.84 
 
 		 813 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 		 817 aa  93.2  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  29.84 
 
 		 802 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 		 802 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>