More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3951 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  100 
 
 
326 aa  667    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  55.06 
 
 
336 aa  345  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  51.9 
 
 
325 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  52.85 
 
 
325 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  52.22 
 
 
321 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  51.24 
 
 
335 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  51.9 
 
 
337 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  50.94 
 
 
336 aa  328  7e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  50.79 
 
 
326 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  50.79 
 
 
326 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  49.53 
 
 
326 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  49.21 
 
 
326 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  49.21 
 
 
326 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  49.21 
 
 
326 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  48.33 
 
 
336 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  49.21 
 
 
326 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  47.11 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  55.34 
 
 
207 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  37.04 
 
 
524 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  35.04 
 
 
439 aa  162  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
367 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  38.62 
 
 
396 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  34.95 
 
 
397 aa  149  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  35.23 
 
 
406 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  35.23 
 
 
406 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  36.72 
 
 
397 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  36.72 
 
 
348 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  34.13 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  36.72 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  38.3 
 
 
405 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 
775 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
783 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  37.09 
 
 
806 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
781 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 
803 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.94 
 
 
772 aa  105  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  39.72 
 
 
807 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  36.42 
 
 
806 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  33.53 
 
 
880 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  33.33 
 
 
809 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 
793 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
898 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  39.31 
 
 
819 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  34.08 
 
 
813 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 
793 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0390  ATP-dependent protease La  33.16 
 
 
800 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.754053  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  35.9 
 
 
810 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 
805 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  38.51 
 
 
820 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  31.71 
 
 
804 aa  102  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  32.84 
 
 
809 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  32.74 
 
 
856 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  34.25 
 
 
798 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  31.6 
 
 
535 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 
808 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  37.18 
 
 
799 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
800 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  34.42 
 
 
796 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0201  ATP-dependent protease La  38.51 
 
 
815 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  39.16 
 
 
811 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  30.1 
 
 
776 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  37.41 
 
 
808 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  32.76 
 
 
797 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  31.88 
 
 
814 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  32.51 
 
 
806 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  34.3 
 
 
807 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  32.51 
 
 
806 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  37.5 
 
 
813 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  36.5 
 
 
809 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  32.47 
 
 
815 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  35.57 
 
 
815 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  29.84 
 
 
776 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  37.24 
 
 
821 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  32.64 
 
 
803 aa  99.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  29.61 
 
 
823 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  29.78 
 
 
815 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  36.48 
 
 
812 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.36 
 
 
805 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  30.9 
 
 
768 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  33.14 
 
 
528 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 
816 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  32.57 
 
 
837 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 
812 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  34.36 
 
 
805 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7407  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
806 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14505  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  35.85 
 
 
812 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  30.86 
 
 
804 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  29.58 
 
 
808 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  38.12 
 
 
812 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6585  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 
806 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.339926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4987  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 
824 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00166311  normal  0.674678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  35.22 
 
 
802 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  29.11 
 
 
807 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  32.53 
 
 
804 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>