More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2125 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  97.85 
 
 
326 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  99.69 
 
 
326 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  668    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  88.04 
 
 
326 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  87.42 
 
 
326 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  86.81 
 
 
326 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  87.42 
 
 
326 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  86.81 
 
 
326 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  86.5 
 
 
336 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  76.38 
 
 
325 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  76.4 
 
 
321 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  75.77 
 
 
325 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  87.44 
 
 
207 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  57.41 
 
 
337 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  57.1 
 
 
336 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  57.63 
 
 
334 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  56.52 
 
 
335 aa  353  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  53.45 
 
 
336 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  51.1 
 
 
326 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  85.47 
 
 
119 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  41.89 
 
 
524 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 
406 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  33.99 
 
 
406 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.7 
 
 
367 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  33.88 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  36.02 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  33.72 
 
 
405 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  32.15 
 
 
397 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.43 
 
 
348 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.43 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  32.83 
 
 
439 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  34 
 
 
768 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  36.43 
 
 
1104 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 
775 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  30.62 
 
 
816 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 
800 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 
800 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 
800 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  35.8 
 
 
835 aa  103  3e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  27.87 
 
 
535 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 
809 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  36.97 
 
 
806 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 
815 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  35.15 
 
 
775 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 
793 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  34.59 
 
 
932 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 
833 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  35 
 
 
936 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  31.17 
 
 
682 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  35 
 
 
936 aa  102  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 
793 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 
824 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 
810 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  36.69 
 
 
815 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 
783 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  36.43 
 
 
1309 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  33.57 
 
 
814 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 
817 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  31.5 
 
 
675 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 
792 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 
803 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  35.71 
 
 
819 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 
786 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  36.13 
 
 
801 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  39.44 
 
 
827 aa  100  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 
813 aa  100  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 
783 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  33.33 
 
 
809 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 
779 aa  99.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  35.15 
 
 
808 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  35.15 
 
 
867 aa  99.8  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  30.24 
 
 
802 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  38.62 
 
 
807 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  32.42 
 
 
800 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  34.29 
 
 
806 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2559  ATP-dependent protease La  35 
 
 
794 aa  99.4  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  35.71 
 
 
794 aa  99  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 
853 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  34.51 
 
 
898 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  27.06 
 
 
825 aa  99  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 
816 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 
774 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 
840 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 
805 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  34.51 
 
 
809 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
812 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 
797 aa  98.6  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 
797 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  35 
 
 
797 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
812 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 
781 aa  99  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
818 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  33.8 
 
 
856 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  34.55 
 
 
806 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>