More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1373 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  100 
 
 		 433 aa  872    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  56.86 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  35.63 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  38.41 
 
 		 336 aa  108  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  32.32 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  32 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  37.5 
 
 		 528 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  33.67 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  33.16 
 
 		 396 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  30.46 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  38.82 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  32.65 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  32.65 
 
 		 441 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  35.42 
 
 		 326 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  34.05 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  34.03 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  34.72 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  32.64 
 
 		 325 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 321 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  36.67 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  32.6 
 
 		 819 aa  89.7  8e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  37.5 
 
 		 393 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  32.18 
 
 		 535 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  38.85 
 
 		 601 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  32.56 
 
 		 809 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 856 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  34.13 
 
 		 814 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 		 825 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  30.05 
 
 		 898 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  28.22 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  28.65 
 
 		 809 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  29.26 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.48 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0764  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 774 aa  84  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  30.56 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  31.36 
 
 		 816 aa  83.2  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  31.4 
 
 		 880 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 799 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  30.89 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  34.3 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  30.72 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  26.52 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  28.78 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  29.24 
 
 		 813 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3009  ATP-dependent protease La  30.12 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.823527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  29.53 
 
 		 802 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 813 aa  80.5  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 793 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  29.07 
 
 		 804 aa  80.5  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  29.59 
 
 		 805 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  32.35 
 
 		 815 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 805 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  31.45 
 
 		 798 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  32.3 
 
 		 817 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  28.21 
 
 		 800 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  26.52 
 
 		 779 aa  80.1  0.00000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 812 aa  79.7  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  27.72 
 
 		 774 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  27.35 
 
 		 768 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  29.28 
 
 		 797 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  27.14 
 
 		 825 aa  80.1  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  30.49 
 
 		 802 aa  79.7  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  30.05 
 
 		 783 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  30.82 
 
 		 1104 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  26.94 
 
 		 814 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  30.23 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  30.72 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  30 
 
 		 811 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004042  ATP-dependent protease La Type I  29.53 
 
 		 783 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000129867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 808 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  35.4 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  30.72 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  30.38 
 
 		 815 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  34.23 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  26.34 
 
 		 775 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  28.49 
 
 		 806 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.4 
 
 		 673 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  30.54 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3326  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 		 837 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.883072  normal  0.129417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  30.23 
 
 		 807 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  29.56 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>