More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2591 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 601 aa  1164    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.26 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  50.46 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  42.75 
 
 		 528 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.89 
 
 		 225 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  43.58 
 
 		 497 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  42.47 
 
 		 674 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  41.44 
 
 		 535 aa  165  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.94 
 
 		 673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  38.94 
 
 		 673 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  33.55 
 
 		 491 aa  151  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  34.52 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  31.72 
 
 		 551 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 		 1309 aa  95.9  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 336 aa  96.3  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  32.08 
 
 		 783 aa  91.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  31.43 
 
 		 815 aa  91.3  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 		 335 aa  91.3  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  33.17 
 
 		 1104 aa  90.9  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  30.24 
 
 		 768 aa  90.9  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0143  ATP-dependent protease La  31.28 
 
 		 794 aa  90.5  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 337 aa  90.1  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  34.56 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 		 797 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 366 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  38.85 
 
 		 433 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 812 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 812 aa  88.2  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  35.42 
 
 		 325 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  33.01 
 
 		 812 aa  87.8  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  31.37 
 
 		 817 aa  87.8  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  34.51 
 
 		 393 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  34.75 
 
 		 334 aa  87  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 325 aa  87  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  36.11 
 
 		 336 aa  86.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  33.75 
 
 		 326 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 		 796 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  31.71 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  34.59 
 
 		 809 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 806 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  31.58 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  36.11 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  28.77 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  36.11 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  30.81 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 835 aa  84.7  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  29.41 
 
 		 812 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  35.57 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 807 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 807 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  30.84 
 
 		 802 aa  84  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  30.65 
 
 		 823 aa  83.6  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  31.55 
 
 		 785 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  30.99 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  30.66 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  30.66 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  30.99 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 756 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  30.99 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  30.99 
 
 		 776 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1532  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.801288  normal  0.268359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 815 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  30.66 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 787 aa  83.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  30.19 
 
 		 773 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  32.23 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  30.66 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2576  ATP-dependent protease La  30.88 
 
 		 802 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0456726  normal  0.0149166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  30.58 
 
 		 805 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.43 
 
 		 808 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  31.07 
 
 		 781 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 813 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 807 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 810 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 		 773 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  30.81 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  30.92 
 
 		 806 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  30.23 
 
 		 808 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0097  ATP-dependent protease La  30.99 
 
 		 793 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 		 800 aa  82  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  29.65 
 
 		 802 aa  81.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 		 867 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  31.93 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  30.52 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1274  ATP-dependent protease La  28.78 
 
 		 806 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00372497  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64463  predicted protein  29.35 
 
 		 935 aa  81.6  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  30.62 
 
 		 853 aa  81.6  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 		 798 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  29.76 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  33.13 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  33.13 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  35.46 
 
 		 932 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  30.29 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>