More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64463 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  44.71 
 
 
1104 aa  755    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64463  predicted protein  100 
 
 
935 aa  1900    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
1309 aa  590  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  36.06 
 
 
882 aa  517  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  33.26 
 
 
800 aa  479  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  37.11 
 
 
835 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  31.61 
 
 
809 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  31.66 
 
 
825 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  35 
 
 
854 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  36.31 
 
 
776 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  36.6 
 
 
776 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  36.46 
 
 
776 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  36.31 
 
 
773 aa  422  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  32.23 
 
 
778 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2169  ATP-dependent protease La  33.02 
 
 
821 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000197845  unclonable  0.00000000135432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  38.04 
 
 
800 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  35.55 
 
 
814 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  32.48 
 
 
827 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  34.73 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  34.37 
 
 
828 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  34.01 
 
 
835 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1469  ATP-dependent protease La  32.52 
 
 
823 aa  406  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00898612  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  32.55 
 
 
797 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0941  ATP-dependent protease La  32.76 
 
 
810 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  33.76 
 
 
835 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  32.13 
 
 
806 aa  397  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  33.46 
 
 
843 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  36.03 
 
 
936 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  36.03 
 
 
936 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  31.78 
 
 
796 aa  392  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  45.45 
 
 
809 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  31.37 
 
 
829 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 
826 aa  385  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 
771 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  28.56 
 
 
805 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  34.83 
 
 
819 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 
812 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  35.64 
 
 
819 aa  374  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  28.34 
 
 
805 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  35.09 
 
 
799 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  40.76 
 
 
816 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
859 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  32.19 
 
 
840 aa  373  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  31.82 
 
 
875 aa  372  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1252  PIM1 peptidase  43.7 
 
 
797 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  41.28 
 
 
799 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  43.89 
 
 
825 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6716  ATP-dependent protease La  32.69 
 
 
798 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.902322  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  35.74 
 
 
853 aa  365  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  39.82 
 
 
807 aa  364  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  39.96 
 
 
808 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  35.65 
 
 
800 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  39.06 
 
 
815 aa  360  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  33.91 
 
 
803 aa  358  2.9999999999999997e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
805 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
805 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  39.29 
 
 
805 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  33.81 
 
 
798 aa  353  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2373  ATP-dependent protease La  42.72 
 
 
807 aa  350  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  37.06 
 
 
802 aa  350  5e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2182  ATP-dependent protease La  40.04 
 
 
804 aa  349  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  41.91 
 
 
804 aa  349  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  40.18 
 
 
792 aa  348  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  41.34 
 
 
806 aa  348  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  34.54 
 
 
817 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 
805 aa  348  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  42.65 
 
 
812 aa  347  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  36.24 
 
 
776 aa  347  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  33.69 
 
 
808 aa  347  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  41.23 
 
 
797 aa  345  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2915  ATP-dependent protease La  40.49 
 
 
805 aa  345  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  38.55 
 
 
816 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  33.91 
 
 
807 aa  345  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  42.22 
 
 
797 aa  345  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  36.05 
 
 
776 aa  344  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2418  ATP-dependent protease La  41.99 
 
 
806 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.805498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2681  ATP-dependent protease La  41.99 
 
 
806 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492035  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  42.43 
 
 
805 aa  343  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  40.77 
 
 
802 aa  343  8e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  40.84 
 
 
817 aa  343  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  40.61 
 
 
804 aa  342  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  38.2 
 
 
802 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  41.79 
 
 
799 aa  342  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  41.58 
 
 
867 aa  342  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  35.63 
 
 
810 aa  341  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5136  ATP-dependent protease La  34.96 
 
 
808 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.53666  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  40.94 
 
 
802 aa  341  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 
802 aa  341  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  41.48 
 
 
775 aa  341  4e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  40.79 
 
 
807 aa  340  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  35.23 
 
 
823 aa  340  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  42.08 
 
 
812 aa  340  8e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  41.58 
 
 
805 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1340  ATP-dependent protease La  41.83 
 
 
805 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501913  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  40.84 
 
 
898 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  41.83 
 
 
812 aa  337  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  41.73 
 
 
810 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  41.25 
 
 
812 aa  337  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  41.94 
 
 
812 aa  337  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  40.69 
 
 
773 aa  337  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>