More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1979 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 497 aa  997    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3813  AAA ATPase central domain protein  44.47 
 
 		 674 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2272  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.92 
 
 		 673 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2122  ATPase  39.92 
 
 		 673 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.317051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  42.47 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.3 
 
 		 523 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.08 
 
 		 225 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  38.14 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2591  AAA ATPase central domain protein  43.58 
 
 		 601 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  39.54 
 
 		 535 aa  156  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  33.71 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5305  ATP-dependent Lon protease-like protein  33.1 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4218  HipA domain-containing protein  41.29 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.234705  normal  0.0892557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2657  ATP-dependent Lon protease-like protein  35.89 
 
 		 552 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4127  ATP dependent lon ATPase  39.47 
 
 		 393 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  34.74 
 
 		 366 aa  96.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  38.82 
 
 		 433 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  31.03 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  31.03 
 
 		 348 aa  93.6  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  31.03 
 
 		 397 aa  93.6  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  29.49 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  29.49 
 
 		 406 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 798 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  33.57 
 
 		 799 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  33.57 
 
 		 799 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  32.87 
 
 		 326 aa  90.1  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 800 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 808 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  32.9 
 
 		 825 aa  88.6  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 805 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  32.87 
 
 		 807 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  33.78 
 
 		 800 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 805 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  33.57 
 
 		 805 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  33.78 
 
 		 800 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  31.03 
 
 		 819 aa  87.8  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 805 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 805 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  32.17 
 
 		 809 aa  87.4  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  34.46 
 
 		 814 aa  86.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  31.07 
 
 		 835 aa  86.7  9e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  32.17 
 
 		 853 aa  86.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  32.6 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  32.41 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  32.17 
 
 		 816 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  28.64 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  33.57 
 
 		 936 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  33.57 
 
 		 936 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  32.41 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  32.87 
 
 		 882 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  28.64 
 
 		 776 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 812 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  31.1 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  30.34 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  31.03 
 
 		 336 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  32.16 
 
 		 326 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 		 1309 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  27.8 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  31.08 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  31.47 
 
 		 815 aa  81.3  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  30.86 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 806 aa  80.9  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  32.52 
 
 		 932 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  32.8 
 
 		 823 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 805 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 793 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  35.17 
 
 		 775 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  33.96 
 
 		 793 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  32.17 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  32.21 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  36.91 
 
 		 778 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  31.49 
 
 		 809 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  31.95 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  32.89 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  34.27 
 
 		 803 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  33.79 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 803 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  33.1 
 
 		 800 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  35.66 
 
 		 819 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5873  ATP-dependent protease La  35.97 
 
 		 785 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5659  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 854 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  34.27 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3307  ATP-dependent protease La  33.79 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  28.83 
 
 		 326 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  29.02 
 
 		 326 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  35.17 
 
 		 867 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  33.79 
 
 		 812 aa  75.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  32.1 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 811 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  32.87 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>