More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4970 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 402 aa  801    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  77.3 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  75.37 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  75.37 
 
 		 406 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  74.32 
 
 		 405 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  57.54 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  57.54 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  63.47 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  38.53 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.44 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  45.39 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  34.13 
 
 		 326 aa  141  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  44.08 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  36.02 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  33.59 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  38.38 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  35.59 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  39.7 
 
 		 336 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  39.7 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  35.74 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  35.98 
 
 		 326 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  35.56 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  34.06 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  34.77 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  37.57 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  33.76 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  34.07 
 
 		 524 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  39.08 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 803 aa  106  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  31.95 
 
 		 781 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 825 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 853 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  34.81 
 
 		 815 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  37.67 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  34.43 
 
 		 789 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  33.76 
 
 		 820 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 		 824 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 		 775 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  33.88 
 
 		 792 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  35.4 
 
 		 800 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  33.54 
 
 		 791 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  30.04 
 
 		 814 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  33.74 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 		 815 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 		 898 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  34.04 
 
 		 826 aa  100  5e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  32.95 
 
 		 840 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 778 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  32.97 
 
 		 816 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  35.44 
 
 		 790 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  35.42 
 
 		 856 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 		 783 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  32.24 
 
 		 800 aa  99.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  33.74 
 
 		 783 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 800 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  32.03 
 
 		 825 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 800 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  31.34 
 
 		 819 aa  98.2  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  32.96 
 
 		 797 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 		 836 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 		 796 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 806 aa  98.6  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  33.74 
 
 		 786 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 798 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 810 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  33.67 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  34.72 
 
 		 809 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  33.99 
 
 		 774 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  32.68 
 
 		 786 aa  97.8  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  29.6 
 
 		 814 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  97.4  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  35.33 
 
 		 803 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 835 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 790 aa  97.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 808 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  31.82 
 
 		 779 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 805 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.33 
 
 		 772 aa  97.1  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  27.71 
 
 		 813 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  32.48 
 
 		 805 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 805 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 819 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0961  DNA-binding, ATP-dependent protease La  31.32 
 
 		 792 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  34.55 
 
 		 528 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2893  ATP-dependent protease La  33.89 
 
 		 812 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.490936  normal  0.0275961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  33.77 
 
 		 799 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0427  ATP-dependent protease La  30.86 
 
 		 820 aa  96.3  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.272294  normal  0.22143 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1589  ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 803 aa  96.3  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 809 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  33.77 
 
 		 799 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  32.67 
 
 		 804 aa  96.3  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3216  ATPase central domain-containing protein  31.05 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>