More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2960 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  99.39 
 
 		 326 aa  661    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  94.48 
 
 		 326 aa  630  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  93.56 
 
 		 326 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  93.25 
 
 		 326 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  92.94 
 
 		 336 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.12 
 
 		 326 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  87.42 
 
 		 326 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  78.57 
 
 		 321 aa  529  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  76.69 
 
 		 325 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  77.91 
 
 		 325 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  92.75 
 
 		 207 aa  394  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  59.62 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  58.44 
 
 		 334 aa  364  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  57.1 
 
 		 336 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  57.94 
 
 		 335 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  55.26 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  49.21 
 
 		 326 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3046  AAA ATPase, central region  91.45 
 
 		 119 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  43.77 
 
 		 524 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  38.61 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  38.61 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  35.77 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  33.96 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  34.36 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  35.98 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  30.74 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  36.28 
 
 		 439 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  40.56 
 
 		 775 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  36.88 
 
 		 1104 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  37.76 
 
 		 800 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0379  ATP-dependent protease La  36.88 
 
 		 809 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00242685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  39.01 
 
 		 816 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  35.18 
 
 		 768 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 		 793 aa  109  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  37.59 
 
 		 800 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2249  ATP-dependent protease La  39.72 
 
 		 815 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.000000234366  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  37.59 
 
 		 800 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2110  ATP-dependent protease La  36.08 
 
 		 793 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  36.17 
 
 		 936 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  36.6 
 
 		 1309 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  36.17 
 
 		 814 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  36.17 
 
 		 936 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  34.78 
 
 		 775 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  36.88 
 
 		 819 aa  107  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  37.82 
 
 		 932 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  36.42 
 
 		 835 aa  107  4e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  36.42 
 
 		 813 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5926  ATP-dependent protease La  34.74 
 
 		 803 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 800 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  37.06 
 
 		 824 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2623  ATP-dependent protease La  39.01 
 
 		 817 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  34.64 
 
 		 809 aa  105  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 		 792 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  37.76 
 
 		 815 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  35.92 
 
 		 809 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  37.06 
 
 		 810 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  32.82 
 
 		 675 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  28.63 
 
 		 805 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0470  hypothetical protein  40.14 
 
 		 827 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  35.62 
 
 		 781 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  38.19 
 
 		 882 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 806 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  35.66 
 
 		 786 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 		 783 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  35.21 
 
 		 856 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 797 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  28.07 
 
 		 812 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 779 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  32.99 
 
 		 853 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 833 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  35.92 
 
 		 898 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  36.62 
 
 		 804 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  36.43 
 
 		 797 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 825 aa  103  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  38.73 
 
 		 801 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  39.16 
 
 		 806 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 798 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 806 aa  103  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  37.32 
 
 		 774 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  28.24 
 
 		 805 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  36.17 
 
 		 807 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1626  ATP-dependent protease La  35.25 
 
 		 880 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.641257  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  34.94 
 
 		 812 aa  102  8e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  34.94 
 
 		 812 aa  102  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 805 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.46 
 
 		 805 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  34.75 
 
 		 811 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  36.17 
 
 		 808 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>