More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5051 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 397 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 348 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  57.36 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  57.36 
 
 		 406 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  57.54 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  57.32 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  56.23 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  32.91 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  31.31 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  33.96 
 
 		 326 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  33.02 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  32.7 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  33.02 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  36.72 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  30.35 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  32.7 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  32.7 
 
 		 326 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  33.74 
 
 		 335 aa  140  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  40.78 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.82 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  44.97 
 
 		 336 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  34.75 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  32.43 
 
 		 326 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  35.22 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.4 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  35.04 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  37.64 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  34.62 
 
 		 207 aa  106  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  30.08 
 
 		 805 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  30.08 
 
 		 805 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  35.57 
 
 		 800 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  35.57 
 
 		 800 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  29.74 
 
 		 816 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  35.76 
 
 		 853 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0670  ATP-dependent protease La  34.94 
 
 		 791 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 798 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  33.52 
 
 		 826 aa  99  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  31.12 
 
 		 805 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  31.12 
 
 		 808 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  35.95 
 
 		 792 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  31.76 
 
 		 824 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  34.44 
 
 		 800 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0056  ATP-dependent protease La  30.8 
 
 		 825 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  31.55 
 
 		 825 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  30.73 
 
 		 829 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1150  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.43 
 
 		 523 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  28.93 
 
 		 800 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3063  ATPase  34.62 
 
 		 528 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.454376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  29.01 
 
 		 840 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  35.95 
 
 		 815 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  32.68 
 
 		 797 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  32.49 
 
 		 789 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  30.61 
 
 		 807 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  33.77 
 
 		 799 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  33.77 
 
 		 799 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  30.4 
 
 		 796 aa  96.3  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0259  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 806 aa  95.5  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485015  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 805 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  31.19 
 
 		 805 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf627  heat shock ATP-dependent protease  33.71 
 
 		 835 aa  95.9  1e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.987281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  35.29 
 
 		 790 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3781  ATPase  32.14 
 
 		 538 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2568  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 		 779 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00834227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 772 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.45 
 
 		 803 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 		 778 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  32.07 
 
 		 535 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  33.56 
 
 		 814 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  32.93 
 
 		 813 aa  94.4  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  30.96 
 
 		 825 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  33.11 
 
 		 809 aa  94.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  33.77 
 
 		 816 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1373  ATP-dependent Lon protease  32.65 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  31.76 
 
 		 497 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  34.44 
 
 		 819 aa  93.2  7e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  31.16 
 
 		 783 aa  93.2  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  31.19 
 
 		 805 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 		 797 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  29.03 
 
 		 819 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 		 815 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  32.21 
 
 		 792 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  34.64 
 
 		 898 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  33.99 
 
 		 775 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  30.37 
 
 		 882 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  32.45 
 
 		 936 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1958  ATP-dependent protease La  32.65 
 
 		 805 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  33.85 
 
 		 792 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  32.45 
 
 		 936 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0952  ATP-dependent protease La  31.18 
 
 		 781 aa  91.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1297  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 787 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0312731  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1158  ATP-dependent protease La  31.44 
 
 		 756 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154728  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  33.11 
 
 		 817 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  34.84 
 
 		 800 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>