More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0056 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 784 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 784 aa  653    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  44.43 
 
 		 815 aa  669    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  43.56 
 
 		 807 aa  646    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  45.7 
 
 		 819 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1158  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 802 aa  652    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.326096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  54.98 
 
 		 810 aa  879    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  43.87 
 
 		 809 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  43.66 
 
 		 809 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 786 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  43.6 
 
 		 806 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  43.75 
 
 		 773 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  44.95 
 
 		 817 aa  695    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  43.14 
 
 		 812 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  43.48 
 
 		 785 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  43.19 
 
 		 798 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  43.75 
 
 		 776 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.75 
 
 		 776 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  43.88 
 
 		 776 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  43 
 
 		 835 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  42.41 
 
 		 810 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3090  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.79 
 
 		 784 aa  653    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.00000000000000593102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  42.93 
 
 		 798 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  43.76 
 
 		 820 aa  670    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1595  ATP-dependent protease La  43.08 
 
 		 785 aa  635    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000103769  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  42.84 
 
 		 801 aa  640    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1510  ATP-dependent protease LA  43.22 
 
 		 786 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293183  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.49 
 
 		 808 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  44.07 
 
 		 773 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1387  peptidase S16, ATP-dependent protease La  44.01 
 
 		 772 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0516  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 784 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  42.93 
 
 		 798 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  42.99 
 
 		 802 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  41.22 
 
 		 780 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  43.22 
 
 		 781 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  43.04 
 
 		 801 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1493  ATP-dependent protease La  42.86 
 
 		 802 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0489479  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1492  ATP-dependent protease La  43.09 
 
 		 785 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000160323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  44.11 
 
 		 805 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2506  ATP-dependent protease La  43.09 
 
 		 785 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000773513  normal  0.491127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  45.19 
 
 		 823 aa  697    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 807 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  43.56 
 
 		 809 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  44.73 
 
 		 815 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  43.75 
 
 		 773 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2097  ATP-dependent protease La  43.1 
 
 		 790 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2052  ATP-dependent protease La  43.59 
 
 		 798 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155836  normal  0.0687597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  43.41 
 
 		 806 aa  651    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  44.65 
 
 		 768 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3230  ATP-dependent protease La  42.89 
 
 		 818 aa  648    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  47.58 
 
 		 843 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  43.17 
 
 		 812 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  43.9 
 
 		 812 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  43.06 
 
 		 803 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  42.71 
 
 		 802 aa  641    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  69.26 
 
 		 816 aa  1188    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  70.67 
 
 		 817 aa  1190    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 797 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  43.1 
 
 		 810 aa  665    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  42.99 
 
 		 823 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3593  ATP-dependent protease La  43.47 
 
 		 805 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.333831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0925  ATP-dependent protease La  43.78 
 
 		 792 aa  661    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  43.73 
 
 		 802 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0906  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.88 
 
 		 784 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000110606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  46.78 
 
 		 828 aa  719    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  43.77 
 
 		 812 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 836 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  43.14 
 
 		 807 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01419  ATP-dependent protease  43.73 
 
 		 783 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  44.1 
 
 		 808 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  43.72 
 
 		 798 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  44.49 
 
 		 814 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 		 789 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 856 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  44.26 
 
 		 802 aa  660    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  43.86 
 
 		 798 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  45.09 
 
 		 806 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  44.05 
 
 		 788 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  43.79 
 
 		 804 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  58.31 
 
 		 813 aa  959    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  43.6 
 
 		 802 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1065  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 812 aa  645    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0475  DNA-binding ATP-dependent protease La  44.27 
 
 		 784 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000237635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  43.48 
 
 		 785 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  43.48 
 
 		 785 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  44 
 
 		 816 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  43.08 
 
 		 783 aa  641    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  44.47 
 
 		 812 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1097  DNA-binding ATP-dependent protease La  43.94 
 
 		 784 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000612483  hitchhiker  0.00000716976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2204  ATP-dependent protease La  43.53 
 
 		 812 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  43.46 
 
 		 798 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0919  ATP-dependent protease La  44.33 
 
 		 813 aa  660    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2679  ATP-dependent protease La  42.97 
 
 		 785 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000848642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  42.91 
 
 		 790 aa  659    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  44.01 
 
 		 812 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  43.48 
 
 		 785 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  43.73 
 
 		 823 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  43.91 
 
 		 805 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  44 
 
 		 785 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  44.87 
 
 		 817 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>