More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3598 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3598  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
524 aa  1051    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3094  ATPase central domain-containing protein  43.77 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2960  ATPase central domain-containing protein  43.77 
 
 
326 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.788064 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2963  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0250  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3296  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2125  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0433  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216154  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0238  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0715483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3383  ATP-dependent protease domain-containing protein  41.51 
 
 
326 aa  192  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6396  AAA ATPase, central region  41.89 
 
 
326 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3049  ATPase central domain-containing protein  41.89 
 
 
326 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0216  ATP-dependent protease domain-containing protein  40.75 
 
 
326 aa  189  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3068  ATPase central domain-containing protein  41.51 
 
 
326 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.39587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2435  AAA ATPase, central region  42.23 
 
 
336 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0386  AAA ATPase central domain protein  39.39 
 
 
321 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0358  ATPase central domain-containing protein  40.15 
 
 
334 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.952613  normal  0.21388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0104  ATPase central domain-containing protein  39.02 
 
 
325 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3951  AAA ATPase, central region  37.04 
 
 
326 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.640542  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3667  ATPase central domain-containing protein  38.75 
 
 
336 aa  174  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1557  ATPase central domain-containing protein  39.1 
 
 
335 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4335  putative ATP-dependent protease La  38.26 
 
 
325 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3432  ATPase central domain-containing protein  36.98 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3140  putative ATPase  36.98 
 
 
336 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000223512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3044  ATPase central domain-containing protein  42.65 
 
 
207 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4327  AAA ATPase, central region  35.33 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2513  AAA ATPase central domain protein  33.53 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.712281 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4599  AAA ATPase  32.63 
 
 
397 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.148058  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0019  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 
367 aa  124  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2926  AAA ATPase central domain protein  32.62 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1690  AAA ATPase central domain protein  32.62 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4970  AAA ATPase central domain protein  34.07 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.395306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1572  AAA ATPase central domain protein  33.46 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5051  ATPase central domain-containing protein  35.04 
 
 
397 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0510695  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3147  AAA ATPase, central region  35.04 
 
 
348 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.550506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5220  ATPase central domain-containing protein  35.04 
 
 
441 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0188  AAA ATPase central domain protein  28.98 
 
 
535 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4278  ATP-dependent protease La  35.8 
 
 
805 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1443  ATP-dependent protease La  35.8 
 
 
805 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.768373  normal  0.638027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4362  ATP-dependent protease La  35.8 
 
 
805 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.304845  normal  0.0378199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1080  ATP-dependent protease La  35.8 
 
 
808 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4579  PIM1 peptidase  35.19 
 
 
807 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4210  ATP-dependent protease La  35.19 
 
 
805 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3944  peptidase S16, ATP-dependent protease La  35.19 
 
 
805 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.036812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1223  ATP-dependent protease La  34.57 
 
 
798 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00879429 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3332  ATP-dependent protease La  33.69 
 
 
816 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4740  putative ATP-dependent protease  34.57 
 
 
799 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.337635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54210  putative ATP-dependent protease  34.57 
 
 
799 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.38684  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52138  predicted protein  28.77 
 
 
936 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1548  ATP-dependent protease La  33.95 
 
 
853 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.984629  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41620  predicted protein  28.77 
 
 
936 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18202  predicted protein  32.72 
 
 
882 aa  95.9  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 
788 aa  95.1  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13920  ATP-dependent protease La  33.95 
 
 
800 aa  94.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.235434  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  31.25 
 
 
788 aa  95.1  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03860  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 
1309 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0591  La-like protease  30.3 
 
 
814 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132222  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  32.69 
 
 
932 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0414  peptidase S16, ATP-dependent protease La  32.99 
 
 
803 aa  92.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3241  ATP-dependent protease La  29.86 
 
 
800 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4588  ATP-dependent protease La 1  33.33 
 
 
776 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.349716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1019  ATP-dependent protease La  29.86 
 
 
800 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000720396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  32.76 
 
 
773 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  32.4 
 
 
773 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4606  ATP-dependent protease La 1  32.76 
 
 
776 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  32.76 
 
 
776 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  32.76 
 
 
776 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  32.76 
 
 
776 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  32.76 
 
 
773 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4557  ATP-dependent protease La 1  32.76 
 
 
776 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0534  PIM1 peptidase  30.18 
 
 
809 aa  91.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0646  ATP-dependent protease La 1  33.33 
 
 
776 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4315  ATP-dependent protease La  32.18 
 
 
773 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0623  Lon family protease  30.81 
 
 
819 aa  90.5  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.209795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1493  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
797 aa  90.1  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  27.78 
 
 
783 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  27.02 
 
 
794 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  27.02 
 
 
794 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
786 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1535  ATP-dependent protease La  31.61 
 
 
825 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3418  ATP-dependent protease La  32.92 
 
 
810 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136554  normal  0.0269191 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  30.41 
 
 
780 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 
810 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3488  ATP-dependent protease La  30.86 
 
 
812 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.438497  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2665  PIM1 peptidase  31.02 
 
 
815 aa  87.4  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1621  ATP-dependent protease La  31.46 
 
 
815 aa  87  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  30.23 
 
 
793 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  31.18 
 
 
811 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  29.9 
 
 
772 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1979  AAA ATPase, central region  32.6 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0485  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 
830 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0185488  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0549  ATP-dependent protease La  29.51 
 
 
792 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.56565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0860  ATP-dependent protease La  30.77 
 
 
807 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06193  mitochondrial serine protease Pim1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11740)  27.96 
 
 
1104 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.030325 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  28.26 
 
 
807 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0516  ATP-dependent protease La  30.29 
 
 
779 aa  85.5  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  28.5 
 
 
800 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3366  ATPase central domain-containing protein  28.65 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.869152  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  36.11 
 
 
775 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  30.9 
 
 
796 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>